La escolarización Secundaria Obligatoria, cuenta en el Colegio Arzobispal con proyectos interdisciplinares de tres horas por curso, así como un aumento de la carga en Inglés, trabajos y aprendizajes cooperativo y el uso del chromebook como herramienta digital a partir de 3º de la ESO.
El horario es intensivo, de 8:30 a 15:00.